Como faço para emitir NF-e de empresas e certificados digitais distintos na mesma maquina?

RESPOSTA: Neste caso, basta que se faça uma rotina na automação que, edite modificando os parametros necessarios da chave [nfe] do regedit, como CNPJ, paths, certificado, logomarca, etc. sempre que o usuario autentique na empresa correspondente. Existe exemplos de edição de registro no app de testes no botão SAIR.